CairoDock的图标分为Launcher和TaskBar，但是也能同时是某程序的Launcher和TaskBar，而且这样比较方便实用。但是经常会遇到，手动加入的Launcher点击了之后，CairoDock会打开另外一个TaskBar来管理程序的窗口［在我的系统里面，Shiretoko版的Firefox根Chromium都出现这情况，不过我添加的Launcher不多］，这是因为这个Launcher没有正确识别到程序窗口的WM_CLASS。可以打开Modify this Launcher，在Extra parameters的Class of the program里面手动修改程序的窗口类名称。
要获得程序的窗口类，可借用xprop，直接在终端里面运行xprop，鼠标会变成十字，在程序的窗口上面单击，然后就会在终端里面刷出一大片信息，留意后面几行的WM_CLASS，比如Chromium的就是
WM_CLASS(STRING) = "chromium-browser", "Chromium-browser"
把Launcher的Class of the program改成Chromium-browser，就works fine了！
这的确是个很烦人的问题，原来是这么个原因导致的
如果是自己从菜单或者桌面拉图标过去的，我觉得是原来的图标没有写明确程序的窗口属性所致；
因为单纯拖一个图标过来，CairoDock不可能知道这个程序的窗口Class；但是他们应该在右击一个TaskBar，Make it a Launcher的时候自动加入窗口类，但是却没有……
原来如此，解决了
@ekeyme: 其实新版cairo-dock里面已经自带这个功能了。点击grab就能读取到窗口的属性。